A,人泛素和五个Bila UBL同源物的多序列比对。大胆和黄色突出显示的残基的全球相似性评分为≥0.7。大胆和红色突出显示的残留物完全保存。使用ESPRIPT56可视化。与...
A,人泛素和五个Bila UBL同源物的多序列比对。大胆和黄色突出显示的残基的全球相似性评分为≥0.7 。大胆和红色突出显示的残留物完全保存。使用ESPRIPT56可视化。与图1C有关。B ,图1d所示的斑块测定的PFU定量 。除UBL G163L突变体外,数据取自13。条代表三个生物学重复的平均值,其单个数据点覆盖了。C,UBL偶联途径中的酶促反应 。E1蛋白的活性位点半胱氨酸与UBL的C末端甘氨酸形成硫酯 ,然后将其转移到E2的活性位点半胱氨酸中,形成另一种硫酯。然后,E2将UBL转移到靶蛋白的赖氨酸残基。去泛素酶(DUB)可以通过将UBL从靶蛋白上裂解来逆转结合 。D ,用标记的E1表达BIL系统的细菌全细胞裂解物的蛋白质印迹。E1的两个频段被揭示。DTT减少了〜70 kDa频带的上部频带,表明E1和UBL之间存在硫酯键 。凹槽用作同一印迹上的加载控制。0.8的OD600的细胞被噬菌体SECPHI27感染。显示了两个生物重复的代表性图像 。E,在UBL免疫沉淀实验中观察到的〜70 kDa条带的质谱分析验证了它包括UBL〜E1复合物(与图1E相关)。根据BIL系统的LFQ强度与突变BIL系统的LFQ强度的LFQ强度 ,绘制了从野生型和突变BIL系统获得的无标签定量(LFQ)强度值的log10。F,Alphafold-Multimer19 UBL与E1之间相互作用的预测。高置信结构(模型置信度为0.94和整体低预测对准误差,面板的右侧)显示G163(表示为球体) 将UBL定位在E1的核苷酸结合环(G217 ,G219和G222;表示为球形)上 。G,在UBL免疫沉淀实验中观察到的〜50 kDa条带的质谱分析验证了E1蛋白(与图1E有关)。分析和绘制的数据如e。H,用标记的E2表达BIL系统的细菌全细胞裂解物的蛋白质印迹 。无法观察到E2的共价复合物。凹槽用作同一印迹上的加载控制。0.8的OD600的细胞被噬菌体SECPHI27感染 。显示了三个生物重复的代表性图像。I ,在UBL免疫沉淀实验中观察到的〜80 kDa条带的质谱分析(与图1E相关)。分析和绘制的数据如e 。MAEB在该频段中被鉴定出来,但是由于MAEB的分子量为82 kDa,因此很可能是无关紧要的,并且不会与UBL共轭。
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我是青鸟号的签约作者“qingdaomobile”!
希望本篇文章《细菌结合泛素样蛋白质以干扰噬菌体组件》能对你有所帮助!
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