染色体相关蛋白的全基因组结构保持染色体完整性和基因调节的定义不当。在这里,我们使用染色质免疫沉淀,外切核酸酶消化和DNA测序(芯片– EXO/SEQ)1,2来定义酿酒酵母中...
染色体相关蛋白的全基因组结构保持染色体完整性和基因调节的定义不当 。在这里 ,我们使用染色质免疫沉淀,外切核酸酶消化和DNA测序(芯片– EXO/SEQ)1,2来定义酿酒酵母中的这种体系结构。我们确定了21种与DNA复制,丝粒,亚端子 ,转座子和RNA聚合酶(POL)I,II,II和III相关的大约400种不同蛋白质组成的元组合。复制蛋白吞噬了核小体 ,centromeres缺乏核小体和抑制性蛋白质,包括亚电体X元素的三个核小体。我们发现,与Pol II相关的大多数启动子进化为缺乏监管区域 ,只有核心启动子 。这些组成型启动子包含与A +1核小体相邻的短核小体区域(NFR),该区域将转录引入因子TFIID结合在一起以形成前发射复合物。定位的绝缘子保护核心启动子免受上游事件的侵害。一小部分启动子进化了诱导性的结构,从而序列特异性转录因子(SSTF)创建了一个与NFR不同的核小体耗电区域(NDR) 。我们描述了SSTF ,它们的同源辅助因子和基因组之间的结构相互作用。这些相互作用包括核小体和转录调节剂RPD3-L,SAGA,NUA4 ,TUP1,介体和SWI – SNF。令人惊讶的是,我们没有检测到SSTF和TFIID之间的相互作用,这表明这种相互作用并不稳定 。我们的基因诱导模型涉及SSTF ,辅助因子和一般因素,例如TBP和TFIIB,但不具有TFIID。相比之下 ,本构的转录涉及TFIID,但不参与其辅助因子的SSTF。由此,我们定义了SSTF的高度集成基因调控网络 。
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希望本篇文章《萌芽酵母基因组的高分辨率蛋白质结构》能对你有所帮助!
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